Rosetta: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
(Utworzono nową stronę "<small>< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Rosetta</small> {{aplikacja|nazwa=Rosetta|logo=Plik:rosetta.png|nofra...") |
|||
| Linia 9: | Linia 9: | ||
Program Rosetta jest dostepny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkownikóœ za darmo. Licencje można uzyskać na stronie [https://www.rosettacommons.org/software/license-and-download Licencja ] | Program Rosetta jest dostepny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkownikóœ za darmo. Licencje można uzyskać na stronie [https://www.rosettacommons.org/software/license-and-download Licencja ] | ||
| + | |||
| + | === Środowisko i praca interaktywna === | ||
| + | Praca z pakietem w trybie interaktywnym jest możliwa po uruchomieniu zadania interaktywnego w jednej z kolejek [[PBS]], np: | ||
| + | > qsub -I -q short6h | ||
| + | |||
| + | Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie: | ||
| + | > module load rosetta/3.2.1 (dla wersji domyślnej - najnowszej) | ||
== Rosetta w sieci == | == Rosetta w sieci == | ||
*[https://www.rosettacommons.org/software Strona domowa] | *[https://www.rosettacommons.org/software Strona domowa] | ||
Wersja z 12:21, 22 lip 2014
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Rosetta
| Rosetta | |
|---|---|
 | |
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 3.2.1 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Rosetta
Program Rosetta służy do modelowania struktóry białek. Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek,enzymów de novo,łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów.
Licencja
Program Rosetta jest dostepny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkownikóœ za darmo. Licencje można uzyskać na stronie Licencja
Środowisko i praca interaktywna
Praca z pakietem w trybie interaktywnym jest możliwa po uruchomieniu zadania interaktywnego w jednej z kolejek PBS, np:
> qsub -I -q short6h
Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie:
> module load rosetta/3.2.1 (dla wersji domyślnej - najnowszej)