Charmm: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| (Nie pokazano 2 pośrednich wersji utworzonych przez tego samego użytkownika) | |||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe | + | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Charmm</small> |
| − | |||
| − | '''Charmm''' ('''C'''hemistry at '''HAR'''ward '''M'''acromolecular '''M'''echanics) - oprogramowanie chemiczne dystrybuowane przez firmę [[Accelrys]]. | + | '''Charmm''' ('''C'''hemistry at '''HAR'''ward '''M'''acromolecular '''M'''echanics) - oprogramowanie chemiczne dystrybuowane kiedyś jako osobny pakiet przez firmę [[Accelrys]]. Obecnie funkcjonalności przeniesione są do modułu '''DS CHARMm''' w [[Discovery Studio]]. |
| − | + | Zespół naukowy może zakupić licencję od prof. Martina Karplusa niezależnie rozwijającego pakiet ([http://www.charmm.org/package/license.html licencja]). | |
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
====Dynamika Langevina pod DS==== | ====Dynamika Langevina pod DS==== | ||
| − | Nie da się stworzyć inputu spod interfejsu DS. Należy zrobić częściowy, potem ręcznie do wygenerowanego pliku dodać linijkę odpowiedzialną za dynamikę Langevina i uruchomić obliczenia. | + | Nie da się stworzyć gotowego inputu dla Charmm'a spod interfejsu DS. Należy zrobić częściowy, potem ręcznie do wygenerowanego pliku dodać linijkę odpowiedzialną za dynamikę Langevina i uruchomić obliczenia. |
==== Charmm w sieci ==== | ==== Charmm w sieci ==== | ||
| − | |||
* [http://www.charmm.org/ Charmm Development Project] | * [http://www.charmm.org/ Charmm Development Project] | ||
* [http://www.ch.embnet.org/MD_tutorial/ Tutorial] | * [http://www.ch.embnet.org/MD_tutorial/ Tutorial] | ||
| − | + | [[Kategoria:Oprogramowanie obecnie niewspierane]] | |
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | |||
| − | [[Kategoria:Oprogramowanie]] | ||
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]] | [[Kategoria:Podręcznik użytkownika]] | ||
Aktualna wersja na dzień 08:16, 15 lis 2012
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Charmm
Charmm (Chemistry at HARward Macromolecular Mechanics) - oprogramowanie chemiczne dystrybuowane kiedyś jako osobny pakiet przez firmę Accelrys. Obecnie funkcjonalności przeniesione są do modułu DS CHARMm w Discovery Studio.
Zespół naukowy może zakupić licencję od prof. Martina Karplusa niezależnie rozwijającego pakiet (licencja).
Dynamika Langevina pod DS
Nie da się stworzyć gotowego inputu dla Charmm'a spod interfejsu DS. Należy zrobić częściowy, potem ręcznie do wygenerowanego pliku dodać linijkę odpowiedzialną za dynamikę Langevina i uruchomić obliczenia.