Bem

Z KdmWiki
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania

< Podręcznik użytkownika KDM < Maszyny obliczeniowe < Bem

Bem
noframe
Kontakt
kdm@wcss.pl

Bem - klaster zainstalowany w WCSS w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon E5-2670v3 (mikroarchitektura Haswell).

Parametry klastra

  • węzeł dostępowy: bem.wcss.pl,
  • 720 węzłów obliczeniowych 24-rdzeniowych (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
  • 192 węzły obliczeniowe 28-rdzeniowe (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell),
  • 22 656 rdzeni obliczeniowych,
  • 74,6 TB pamięci RAM (64, 128 lub 512 GB/węzeł),
  • przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 11 TB NFS /home,
  • przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
  • sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1),
  • sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
  • system operacyjny: CentOS 6.8,
  • moc obliczeniowa: 860 TFLOPS.

Oprogramowanie

Aplikacje

Abaqus, ABINIT, ADF, Amber, ANSYS CFX, ANSYS Fluent, Cfour, Comsol, CP2K, CPMD, CRYSTAL09, Dalton, FDS-SMV, GAMESS, Gaussian, Gromacs, LAMMPS, LumericalFDTD, MODE ], Mathematica, Matlab, Molcas, Molpro, NWChem, Orca, R, Siesta, TURBOMOLE i inne oraz aplikacje własne użytkowników.

Kompilatory

GNU GCC, Intel, PGI i inne.

Biblioteki i narzędzia
  • OpenMPI,
  • HDF, HDF5,
  • NetCDF,
  • Python + SciPy + NumPy,
  • pozostałe.
System kolejkowania

PBSPro.

Zalecenia

  • na dysku /home wprowadzone zostały kwoty dyskowe: limit 50GB; sprawdzenie stanu:
quota

opis systemu kwot:

man quota

Zobacz też