Tekst źródłowy strony Bem

<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Maszyny obliczeniowe]] < Bem</small>
<!--{{note|Przerwa serwisowa klastra: 17 sierpnia - 21 sierpnia 2015}}-->
{{serwer
|nazwa=Bem
|zdjęcie=bem.jpg
|admini=kdm@wcss.pl
}}
'''Bem''' - klaster zainstalowany w [[WCSS]] w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon (mikroarchitektura Haswell).

=== Parametry klastra ===

* węzeł dostępowy dla użytkowników lokalnych KDM WCSS: '''bem.wcss.pl''',
* węzeł dostępowy dla użytkowników PL-Grid: '''ui.wcss.pl''',
* 688 węzłów obliczeniowych 24-rdzeniowych z 64 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
* 32 węzły obliczeniowe 24-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
* 182 węzły obliczeniowe 28-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell),
* 10 węzłów obliczeniowych 28-rdzeniowych z 512 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell),
* 22 656 rdzeni obliczeniowych,
* 74,6 TB pamięci RAM,
* przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 50 TB NFS,
* przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
* sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1),
* sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
* system operacyjny: Linux CentOS 6,
* moc obliczeniowa: 860 TFLOPS.

Pamięć operacyjna dostępna dla zadań obliczeniowych jest mniejsza niż pamięć zainstalowana fizycznie i wynosi:
* dla węzłów z zainstalowanymi 64 GB pamięci fiz. - 60000 MB,
* dla węzłów z zainstalowanymi 128 GB pamięci fiz. - 125000 MB,
* dla węzłów z zainstalowanymi 512 GB pamięci fiz. - 500000 MB.

=== Oprogramowanie ===
;Aplikacje
[[Abaqus]], [[ABINIT]], [[ADF]], [[Amber]], [[ANSYS CFX]], [[ANSYS Fluent]], [[Cfour]], [[Comsol]], [[CP2K]], [[CPMD]], [[CRYSTAL09]], [[Dalton]], [[DIRAC]], [[FDS-SMV]], [[GAMESS]], [[Gaussian]], [[Gromacs]], [[LAMMPS]], [[Lumerical]] [&nbsp;[[Lumerical FDTD|FDTD]], [[Lumerical MODE|MODE]]&nbsp;], [[Mathematica]], [[Matlab]], [[Molcas]], [[Molpro]], [[NWChem]], [[Orca]], [[R]], [[Siesta]], [[TensorFlow]], [[TURBOMOLE]] i [[Oprogramowanie_naukowe|inne]] oraz aplikacje własne użytkowników.

;Kompilatory
[[GNU GCC]], [[Intel]], [[PGI]] i [[Oprogramowanie_systemowe_i_narzędziowe|inne]].

;Biblioteki i narzędzia
* OpenMPI,
* HDF, HDF5,
* NetCDF,
* Python + SciPy + NumPy,
* [[Oprogramowanie_systemowe_i_narzędziowe|pozostałe]].

;System kolejkowania 
[[PBSPro]].

===Zalecenia===

Na dysku /home wprowadzone są kwoty dyskowe: domyślny limit wynosi 50 GB. Sprawdzenie stanu:
 quota -s -f ~

Podręcznik systemowy dla polecenia quota:
 man quota

===Zobacz też===
*[[Maszyny obliczeniowe]]

{{maszyny obliczeniowe}}

[[Kategoria:Maszyny obliczeniowe]]
[[Kategoria:Podręcznik użytkownika]]