Warsztaty - ABINIT: Różnice pomiędzy wersjami
(Utworzył nową stronę „WCSS zaprasza na warsztaty z programu ABINIT. *'''Data:''' semestr letni 2011 *'''Miejsce:''' *'''Temat:''' *'''Prowadzący:''' * '''Materiały:''' ==Zgłosze...”) |
|||
(Nie pokazano 41 pośrednich wersji utworzonych przez tego samego użytkownika) | |||
Linia 1: | Linia 1: | ||
[[WCSS]] zaprasza na warsztaty z programu ABINIT. | [[WCSS]] zaprasza na warsztaty z programu ABINIT. | ||
− | *''' | + | *'''Termin: wtorek, 17.05-18.55''' semestr letni 2011 |
− | *'''Miejsce:''' | + | *'''Miejsce: Instytut Fizyki PWR, budynek A-1, sala 320A''' |
− | *'''Temat:''' | + | *'''Temat:''' wybrane możliwości obliczeniowe pakietu ABINIT; podstawy teoretyczne; zajęcia praktyczne. |
− | *'''Prowadzący:''' | + | *'''Prowadzący:''' dr inż. Paweł Scharoch, Instytut Fizyki PWR |
− | * '''Materiały:''' | + | * '''Materiały:''' http://www.abinit.org/, http://www.if.pwr.wroc.pl/~scharoch/Abinitio/Warsztaty.html |
==Zgłoszenia== | ==Zgłoszenia== | ||
Udział w warsztatach jest bezpłatny dla użytkowników KDM WCSS. | Udział w warsztatach jest bezpłatny dla użytkowników KDM WCSS. | ||
− | Zgłoszenia, zawierające imię i nazwisko oraz nazwę miejsca pracy zgłaszanej osoby można kierować do prowadzącego ('' | + | Zgłoszenia, zawierające imię i nazwisko oraz nazwę miejsca pracy zgłaszanej osoby można kierować do prowadzącego (''pawel.scharoch@pwr.wroc.pl''). W temacie listu należy umieścić słowa: "Warsztaty ABINIT". |
==Wymagania == | ==Wymagania == | ||
− | + | Znajomość podstaw mechaniki kwantowej. Znajomość podstawowych komend systemu LINUX. Przydatny laptop z systemem LINUX. | |
==Plan zajęć== | ==Plan zajęć== | ||
+ | |||
+ | Pierwsze spotkanie w dniu 22.03.2011r., sala 321, budynek A-1 (PWR, Wyb. Wyspiańskiego 27) | ||
+ | (klatka schodowa po prawej stronie patrząc od wejścia głównego, na drugim piętrze). | ||
+ | |||
+ | Spotkanie pierwsze: | ||
+ | |||
+ | 1.Przegląd strony www projektu ABINIT | ||
+ | |||
+ | 2.O projekcie ABINIT | ||
+ | |||
+ | 3.Wprowadzenie do programu ABINIT | ||
+ | |||
+ | 4.Dyskusja na temat formuły warsztatów (propozycje prezentacji) | ||
+ | |||
+ | 5.Wprowadzenie od obliczeń z zasad pierwszych opartych na teorii funkcjonału gęstości, przyblizenia funkcjonałów korelacji-wymiany | ||
+ | |||
+ | 6.Reprezentacja równań Kohan-Shama w bazie fal płaskich. | ||
+ | |||
+ | Spotkanie drugie: | ||
+ | |||
+ | 1. Omówienie struktury plików wejściowych | ||
+ | |||
+ | 2. Podstawowe parametry obliczeniowe | ||
+ | |||
+ | 3. Przegląd głównego pliku wyjściowego *.out | ||
+ | |||
+ | 4. Lekcja 1: cząsteczka H2 w superkomórce, bez analizy zbieżności (pierwsze uruchomienie programu, obliczenia energii całkowitej, wyznaczanie długości równowagowej cząsteczki metodą skanowania energii). | ||
+ | |||
+ | Spotkanie trzecie i czwarte: | ||
+ | |||
+ | 1. Lekcja 1 (kontynuacja) (wyznaczanie długości równowagowej cząsteczki metodą relaksacji, wyznaczanie energii atomizacji) | ||
+ | |||
+ | 2. Wykorzystanie programów AWK i GREP do analizy plików wyjściowych | ||
+ | |||
+ | 3. Lekcja 2, cząsteczka H2 z analizą zbieżności (zbieżność ze względu na energię odcięcia i parametr sieci, obliczenia końcowe z wykorzystaniem funkcjonałów LDA i GGA) | ||
+ | |||
+ | 4. Program pomocniczy cut3D | ||
+ | |||
+ | 5. Wizualizacje z wykorzystaniem programu GNUPLOT (zbieżność energii, gęstość elektronowa, potencjał). | ||
+ | |||
+ | Spotkanie piąte: | ||
+ | |||
+ | 1. Wprowadzenie do teorii funkcjonału gęstości. | ||
+ | |||
+ | 2. Pseudopotencjały zachowujace normę. | ||
+ | |||
+ | Spotkanie szóste: | ||
+ | |||
+ | 1. Pseudopotencjały zachowujące normę: konstruowanie – od postaci nielokalnej do | ||
+ | w pełni rozseparowanej | ||
+ | |||
+ | 2. Lekcja 3 – kryształ krzemu; znaczenie specjalnych punktów k (testowanie zbieżności), | ||
+ | wyznaczanie parametrów sieci, wyznaczanie struktury pasmowej Kohna-Shama | ||
+ | (obliczenia niesamouzgodnione) | ||
+ | |||
+ | Spotkanie siódme i ósme: | ||
+ | |||
+ | 1. Kryształ i powierzchnia aluminium; znaczenie parametru 'tsmear', rozkład gęstości ładunku w metalu | ||
+ | |||
+ | 2. Modelowanie powierzchni i układów adsorbatów; wyznaczanie energii powierzchniowej (zbieżność ze | ||
+ | względu na grubość warstwy atomów i warstwy próżni) | ||
+ | |||
+ | Spotkanie dziewiąte: | ||
+ | |||
+ | 1. Odpowiedź układu na zaburzenie zewnętrzne: odchylenie atomu z polożenia równowagi, odkształecenie | ||
+ | kryształu, pole elektryczne, zaburzenia mieszane; metody "bezpośrednie" i oparte na rachunku zaburzeń funkcjonału | ||
+ | gestości (DFPT) | ||
+ | |||
+ | 2. Dynamika/termodynamika sieci w przybliżeniu harmonicznym - wprowadzenie. | ||
+ | |||
+ | Spotkanie dziesiąte: | ||
+ | |||
+ | 1. Lekcja - funkcja odpowiedzi 1; podstawy wyznaczania funkcji liniowej dpowiedzi: dynamiczne i dielektryczne | ||
+ | własności AlAs (fonony, tensor dielektryczny, ładunek efektywny Borna) | ||
+ | |||
+ | 2. Lekcja - analiza bazy danych pochodnych (DDB - 'Derivative Data Base') | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | ---------------------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | '''Proszę o zgłaszanie tematów szczegółowych (do omówienia i przećwiczenia w ramach warsztatów)''' | ||
+ | ---------------------------------------------------------------------------------------- | ||
+ | |||
+ | Wstępne propozycje tematów szczegółowych (prezentacje teoretyczne i zajęcia praktyczne): | ||
+ | |||
+ | 1.Elementy teorii funkcjonału gęstości | ||
+ | |||
+ | 2.Stan podstawowy układu (cząsteczka, kryształ, powierzchnia+adsorbaty, warstwy wolno stojące, druty) | ||
+ | - struktura geometryczna i elektronowa | ||
+ | - wizualizacja geometrii i gęstości elektronowej | ||
+ | - energetyczna gęstość stanów, rzutowana gęstość stanów | ||
+ | |||
+ | 3.Odpowiedź układu na zaburzenia zewnętrzne | ||
+ | - przemieszczenia atomów | ||
+ | - odkształcenia makroskopowe | ||
+ | - pole elektryczne | ||
+ | - zaburzenia mieszane. | ||
+ | Metody bezpośrednie i oparte na rachunku zaburzeń funkcjonału gęstości (DFPT); odpowiedź liniowa i nieliniowa. | ||
+ | |||
+ | 4.Dynamika/termodynamika układów | ||
+ | - przybliżenie harmoniczne | ||
+ | - dynamika molekularna | ||
+ | |||
+ | 5.Stany wzbudzone | ||
+ | - metoda Δ(SCF) | ||
+ | - teoria funkcjonału gęstości zależnego od czasu (tylko układy zlokalizowane) | ||
+ | -GW | ||
+ | |||
+ | 6.Reprezentacje atomów | ||
+ | - pseudopotencjały zachowujące normę | ||
+ | - PAWy | ||
+ | |||
+ | 7.Magnetyzm kolinearny i niekolinearny | ||
+ | |||
+ | |||
Aktualna wersja na dzień 09:55, 9 maj 2011
WCSS zaprasza na warsztaty z programu ABINIT.
- Termin: wtorek, 17.05-18.55 semestr letni 2011
- Miejsce: Instytut Fizyki PWR, budynek A-1, sala 320A
- Temat: wybrane możliwości obliczeniowe pakietu ABINIT; podstawy teoretyczne; zajęcia praktyczne.
- Prowadzący: dr inż. Paweł Scharoch, Instytut Fizyki PWR
- Materiały: http://www.abinit.org/, http://www.if.pwr.wroc.pl/~scharoch/Abinitio/Warsztaty.html
Zgłoszenia
Udział w warsztatach jest bezpłatny dla użytkowników KDM WCSS.
Zgłoszenia, zawierające imię i nazwisko oraz nazwę miejsca pracy zgłaszanej osoby można kierować do prowadzącego (pawel.scharoch@pwr.wroc.pl). W temacie listu należy umieścić słowa: "Warsztaty ABINIT".
Wymagania
Znajomość podstaw mechaniki kwantowej. Znajomość podstawowych komend systemu LINUX. Przydatny laptop z systemem LINUX.
Plan zajęć
Pierwsze spotkanie w dniu 22.03.2011r., sala 321, budynek A-1 (PWR, Wyb. Wyspiańskiego 27) (klatka schodowa po prawej stronie patrząc od wejścia głównego, na drugim piętrze).
Spotkanie pierwsze:
1.Przegląd strony www projektu ABINIT
2.O projekcie ABINIT
3.Wprowadzenie do programu ABINIT
4.Dyskusja na temat formuły warsztatów (propozycje prezentacji)
5.Wprowadzenie od obliczeń z zasad pierwszych opartych na teorii funkcjonału gęstości, przyblizenia funkcjonałów korelacji-wymiany
6.Reprezentacja równań Kohan-Shama w bazie fal płaskich.
Spotkanie drugie:
1. Omówienie struktury plików wejściowych
2. Podstawowe parametry obliczeniowe
3. Przegląd głównego pliku wyjściowego *.out
4. Lekcja 1: cząsteczka H2 w superkomórce, bez analizy zbieżności (pierwsze uruchomienie programu, obliczenia energii całkowitej, wyznaczanie długości równowagowej cząsteczki metodą skanowania energii).
Spotkanie trzecie i czwarte:
1. Lekcja 1 (kontynuacja) (wyznaczanie długości równowagowej cząsteczki metodą relaksacji, wyznaczanie energii atomizacji)
2. Wykorzystanie programów AWK i GREP do analizy plików wyjściowych
3. Lekcja 2, cząsteczka H2 z analizą zbieżności (zbieżność ze względu na energię odcięcia i parametr sieci, obliczenia końcowe z wykorzystaniem funkcjonałów LDA i GGA)
4. Program pomocniczy cut3D
5. Wizualizacje z wykorzystaniem programu GNUPLOT (zbieżność energii, gęstość elektronowa, potencjał).
Spotkanie piąte:
1. Wprowadzenie do teorii funkcjonału gęstości.
2. Pseudopotencjały zachowujace normę.
Spotkanie szóste:
1. Pseudopotencjały zachowujące normę: konstruowanie – od postaci nielokalnej do w pełni rozseparowanej
2. Lekcja 3 – kryształ krzemu; znaczenie specjalnych punktów k (testowanie zbieżności), wyznaczanie parametrów sieci, wyznaczanie struktury pasmowej Kohna-Shama (obliczenia niesamouzgodnione)
Spotkanie siódme i ósme:
1. Kryształ i powierzchnia aluminium; znaczenie parametru 'tsmear', rozkład gęstości ładunku w metalu
2. Modelowanie powierzchni i układów adsorbatów; wyznaczanie energii powierzchniowej (zbieżność ze względu na grubość warstwy atomów i warstwy próżni)
Spotkanie dziewiąte:
1. Odpowiedź układu na zaburzenie zewnętrzne: odchylenie atomu z polożenia równowagi, odkształecenie kryształu, pole elektryczne, zaburzenia mieszane; metody "bezpośrednie" i oparte na rachunku zaburzeń funkcjonału gestości (DFPT)
2. Dynamika/termodynamika sieci w przybliżeniu harmonicznym - wprowadzenie.
Spotkanie dziesiąte:
1. Lekcja - funkcja odpowiedzi 1; podstawy wyznaczania funkcji liniowej dpowiedzi: dynamiczne i dielektryczne własności AlAs (fonony, tensor dielektryczny, ładunek efektywny Borna)
2. Lekcja - analiza bazy danych pochodnych (DDB - 'Derivative Data Base')
Proszę o zgłaszanie tematów szczegółowych (do omówienia i przećwiczenia w ramach warsztatów)
Wstępne propozycje tematów szczegółowych (prezentacje teoretyczne i zajęcia praktyczne):
1.Elementy teorii funkcjonału gęstości
2.Stan podstawowy układu (cząsteczka, kryształ, powierzchnia+adsorbaty, warstwy wolno stojące, druty) - struktura geometryczna i elektronowa - wizualizacja geometrii i gęstości elektronowej - energetyczna gęstość stanów, rzutowana gęstość stanów
3.Odpowiedź układu na zaburzenia zewnętrzne - przemieszczenia atomów - odkształcenia makroskopowe - pole elektryczne - zaburzenia mieszane. Metody bezpośrednie i oparte na rachunku zaburzeń funkcjonału gęstości (DFPT); odpowiedź liniowa i nieliniowa.
4.Dynamika/termodynamika układów - przybliżenie harmoniczne - dynamika molekularna
5.Stany wzbudzone - metoda Δ(SCF) - teoria funkcjonału gęstości zależnego od czasu (tylko układy zlokalizowane) -GW
6.Reprezentacje atomów - pseudopotencjały zachowujące normę - PAWy
7.Magnetyzm kolinearny i niekolinearny