Virtualenv: Różnice pomiędzy wersjami
Linia 1: | Linia 1: | ||
− | '''Virtualenv''' jest narzędziem umożliwiającym tworzenie i zarządzanie środowiskami Pythona. | + | '''Virtualenv''' jest narzędziem umożliwiającym tworzenie i zarządzanie środowiskami Pythona. Można je stosować do instalacji pakietów Pythona we własnym katalogu domowym. |
== Jak używać == | == Jak używać == | ||
− | Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł | + | Poniżej zaprezentowano procedurę instalacji pakietu cif2cell w środowisku wirtualnym Pythona. |
+ | |||
+ | Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona | ||
qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb | qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb | ||
module load python | module load python | ||
+ | |||
+ | Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/cif2cell) | ||
+ | |||
+ | virtualenv $HOME/cif2cell | ||
+ | |||
+ | Uruchom utworzone środowisko wirtualne | ||
+ | |||
+ | source $HOME/cif2cell/bin/activate | ||
+ | |||
+ | Pobierz odpowiedni moduł (w tym przypadku do instalacji cif2cell wymagany jest moduł PyCIFRW) | ||
+ | |||
+ | pip install PyCIFRW | ||
+ | |||
+ | Zainstaluj pakiet cif2cell w katalogu $HOME/cif2cell. | ||
+ | |||
+ | W tym celu rozpakuj pobrane pliki pakietu cif2cell i przejdź do katalogu ze źródłami tego pakietu | ||
+ | |||
+ | tar -xf cif2cell-1.2.10.tar.gz | ||
+ | cd cif2cell-1.2.10 | ||
+ | |||
+ | oraz uruchom polecenie | ||
+ | |||
+ | python setup.py install --prefix=$HOME/cif2cell | ||
+ | |||
+ | W katalogu $HOME/cif2cell/bin utworzony zostanie plik wykonywalny cif2cell. | ||
+ | |||
+ | Aby użyć zainstalowanego oprogramowania cif2cell należy wykonać polecenie | ||
+ | |||
+ | $HOME/cif2cell/bin/cif2cell |
Wersja z 11:14, 2 mar 2018
Virtualenv jest narzędziem umożliwiającym tworzenie i zarządzanie środowiskami Pythona. Można je stosować do instalacji pakietów Pythona we własnym katalogu domowym.
Jak używać
Poniżej zaprezentowano procedurę instalacji pakietu cif2cell w środowisku wirtualnym Pythona.
Uruchom zadanie interaktywne i załaduj moduł Pythona
qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=python -l select=1:ncpus=1:mem=1000mb module load python
Utwórz środowisko wirtualne w wybranym katalogu (w tym przykładzie będzie to katalog $HOME/cif2cell)
virtualenv $HOME/cif2cell
Uruchom utworzone środowisko wirtualne
source $HOME/cif2cell/bin/activate
Pobierz odpowiedni moduł (w tym przypadku do instalacji cif2cell wymagany jest moduł PyCIFRW)
pip install PyCIFRW
Zainstaluj pakiet cif2cell w katalogu $HOME/cif2cell.
W tym celu rozpakuj pobrane pliki pakietu cif2cell i przejdź do katalogu ze źródłami tego pakietu
tar -xf cif2cell-1.2.10.tar.gz cd cif2cell-1.2.10
oraz uruchom polecenie
python setup.py install --prefix=$HOME/cif2cell
W katalogu $HOME/cif2cell/bin utworzony zostanie plik wykonywalny cif2cell.
Aby użyć zainstalowanego oprogramowania cif2cell należy wykonać polecenie
$HOME/cif2cell/bin/cif2cell