Bem: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 23: Linia 23:
 
=== Oprogramowanie ===
 
=== Oprogramowanie ===
 
;Aplikacje
 
;Aplikacje
[[Abaqus]], [[ADF]], [[ANSYS CFX]], [[ANSYS Fluent]], [[CRYSTAL09]], [[Dalton]], [[Gaussian]], [[Gromacs]], [[Mathematica]], [[Matlab]], [[Molcas]], [[Molpro]], [[NWChem]], [[Orca]], [[R]], [[Siesta]], [[TURBOMOLE]], aplikacje własne użytkowników.
+
[[Abaqus]], [[Abinit]], [[ADF]], [[ANSYS CFX]], [[ANSYS Fluent]], [[CP2K]], [[CPMD]], [[CRYSTAL09]], [[Dalton]], [[Gaussian]], [[Gromacs]], [[LAMMPS]], [[Mathematica]], [[Matlab]], [[Molcas]], [[Molpro]], [[NWChem]], [[Orca]], [[R]], [[Siesta]], [[TURBOMOLE]], aplikacje własne użytkowników.
  
 
;Kompilatory
 
;Kompilatory

Wersja z 12:20, 7 lip 2015

< Podręcznik użytkownika KDM < Maszyny obliczeniowe < Bem

Bem
noframe
Kontakt
kdm@wcss.pl

Bem - klaster zainstalowany w WCSS w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon E5-2670v3 (mikroarchitektura Haswell).

Parametry klastra

  • węzeł dostępowy: bem.wcss.pl,
  • 720 węzłów obliczeniowych (po 2 procesory 12 rdzeniowe),
  • 17 280 rdzeni obliczeniowych,
  • 47 TB pamięci RAM (64 GB/węzeł, 32 węzły po 128GB/węzeł),
  • przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 11 TB NFS /home,
  • przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
  • sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (współczynnik blokowania 3:1),
  • sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
  • system operacyjny: ScientificLinux 6.6,
  • moc obliczeniowa: 640 TFLOPS.

Oprogramowanie

Aplikacje

Abaqus, Abinit, ADF, ANSYS CFX, ANSYS Fluent, CP2K, CPMD, CRYSTAL09, Dalton, Gaussian, Gromacs, LAMMPS, Mathematica, Matlab, Molcas, Molpro, NWChem, Orca, R, Siesta, TURBOMOLE, aplikacje własne użytkowników.

Kompilatory

GNU GCC, Intel, PGI.

Biblioteki i narzędzia
  • OpenMPI,
  • HDF, HDF5,
  • NetCDF,
  • Python + SciPy + NumPy.
System kolejkowania

PBSPro.

Zobacz też