Bem: Różnice pomiędzy wersjami
| Linia 32: | Linia 32: | ||
=== Oprogramowanie === | === Oprogramowanie === | ||
;Aplikacje | ;Aplikacje | ||
| − | [[Abaqus]], [[ABINIT]], [[ADF]], [[Amber]], [[ANSYS CFX]], [[ANSYS Fluent]], [[Cfour]], [[Comsol]], [[CP2K]], [[CPMD]], [[CRYSTAL09]], [[Dalton]], [[DIRAC]], [[FDS-SMV]], [[GAMESS]], [[Gaussian]], [[Gromacs]], [[LAMMPS]], [[Lumerical]] [ [[Lumerical FDTD|FDTD]], [[Lumerical MODE|MODE]] ], [[Mathematica]], [[Matlab]], [[Molcas]], [[Molpro]], [[NWChem]], [[Orca]], [[R]], [[Siesta]], [[TURBOMOLE]] i [[Oprogramowanie_naukowe|inne]] oraz aplikacje własne użytkowników. | + | [[Abaqus]], [[ABINIT]], [[ADF]], [[Amber]], [[ANSYS CFX]], [[ANSYS Fluent]], [[Cfour]], [[Comsol]], [[CP2K]], [[CPMD]], [[CRYSTAL09]], [[Dalton]], [[DIRAC]], [[FDS-SMV]], [[GAMESS]], [[Gaussian]], [[Gromacs]], [[LAMMPS]], [[Lumerical]] [ [[Lumerical FDTD|FDTD]], [[Lumerical MODE|MODE]] ], [[Mathematica]], [[Matlab]], [[Molcas]], [[Molpro]], [[NWChem]], [[Orca]], [[R]], [[Siesta]], [[TensorFlow]], [[TURBOMOLE]] i [[Oprogramowanie_naukowe|inne]] oraz aplikacje własne użytkowników. |
;Kompilatory | ;Kompilatory | ||
Wersja z 12:20, 28 maj 2019
< Podręcznik użytkownika KDM < Maszyny obliczeniowe < Bem
| Bem |
|---|
 |
| Kontakt |
| kdm@wcss.pl |
Bem - klaster zainstalowany w WCSS w marcu 2015 r. Architektura wszystkich komputerów to x86_64 z procesorami Intel Xeon (mikroarchitektura Haswell).
Parametry klastra
- węzeł dostępowy dla użytkowników lokalnych KDM WCSS: bem.wcss.pl,
- węzeł dostępowy dla użytkowników PL-Grid: ui.wcss.pl,
- 688 węzłów obliczeniowych 24-rdzeniowych z 64 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
- 32 węzły obliczeniowe 24-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2670 v3 2.3 GHz, Haswell),
- 182 węzły obliczeniowe 28-rdzeniowe ze 128 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell),
- 10 węzłów obliczeniowych 28-rdzeniowych z 512 GB pamięci oper. (Intel Xeon E5-2697 v3 2.6 GHz, Haswell),
- 22 656 rdzeni obliczeniowych,
- 74,6 TB pamięci RAM,
- przestrzeń na katalogi domowe użytkowników: 50 TB NFS,
- przestrzeń tymczasowa: 1,1 PB Lustre,
- sieć obliczeniowa: Infiniband FDR, przepływność 56 Gbps (topologia fat-tree, współczynnik blokowania 3:1),
- sieć zarządzania: Ethernet 1G/10G,
- system operacyjny: Linux CentOS 6,
- moc obliczeniowa: 860 TFLOPS.
Pamięć operacyjna dostępna dla zadań obliczeniowych jest mniejsza niż pamięć zainstalowana fizycznie i wynosi:
- dla węzłów z zainstalowanymi 64 GB pamięci fiz. - 60000 MB,
- dla węzłów z zainstalowanymi 128 GB pamięci fiz. - 125000 MB,
- dla węzłów z zainstalowanymi 512 GB pamięci fiz. - 500000 MB.
Oprogramowanie
- Aplikacje
Abaqus, ABINIT, ADF, Amber, ANSYS CFX, ANSYS Fluent, Cfour, Comsol, CP2K, CPMD, CRYSTAL09, Dalton, DIRAC, FDS-SMV, GAMESS, Gaussian, Gromacs, LAMMPS, Lumerical [ FDTD, MODE ], Mathematica, Matlab, Molcas, Molpro, NWChem, Orca, R, Siesta, TensorFlow, TURBOMOLE i inne oraz aplikacje własne użytkowników.
- Kompilatory
- Biblioteki i narzędzia
- OpenMPI,
- HDF, HDF5,
- NetCDF,
- Python + SciPy + NumPy,
- pozostałe.
- System kolejkowania
Zalecenia
Na dysku /home wprowadzone są kwoty dyskowe: domyślny limit wynosi 50 GB. Sprawdzenie stanu:
quota -s -f /home
Podręcznik systemowy dla polecenia quota:
man quota
Zobacz też
| Maszyny obliczeniowe | Bem ⋅ Klaster kampusowy |
|---|