Rosetta: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 19: | Linia 19: | ||
=== Rosetta w sieci === | === Rosetta w sieci === | ||
*[https://www.rosettacommons.org/software Strona domowa] | *[https://www.rosettacommons.org/software Strona domowa] | ||
| + | |||
| + | |||
| + | {{oprogramowanie}} | ||
| + | [[Kategoria:Oprogramowanie]] | ||
Wersja z 09:37, 5 sie 2014
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Rosetta
| Rosetta | |
|---|---|
 | |
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 3.2.1 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Rosetta
Program Rosetta służy do modelowania struktóry białek. Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek, enzymów de novo, łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów.
Licencja
Program Rosetta jest dostepny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkownikóœ za darmo. Licencje można uzyskać na stronie Licencja
Środowisko i praca interaktywna
Praca z pakietem w trybie interaktywnym jest możliwa po uruchomieniu zadania interaktywnego w jednej z kolejek PBS, np:
> qsub -I -q short6h
Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie:
> module load rosetta/3.2.1 (dla wersji domyślnej - najnowszej)
Rosetta w sieci
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|