VMD
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < VMD
| VMD | |
|---|---|
 | |
| Serwer | Wersja |
| Bem | 1.9.3 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
VMD (Visual Molecular Dynamics) – oprogramowanie do modelowania, wizualizacji i analizy systemów biologicznych (m.in. białek, kwasów nukleinowych, lipidów).
Licencja
Aby uzyskać dostęp do modułu VMD należy dokonać rejestracji na stronie domowej produktu, zrobić zrzut ekranu potwierdzający proces rejestracji (Przykładowy zrzut), a następnie wysłać na adres kdm@wcss.pl.
Uruchamianie VMD
- Do uruchomiania programów graficzanych, zalecane jest łączenie się ze zdalnym pulpitem za pomocą programu NoMachine. Aby uruchomić program, należy w terminalu uruchomionym w aplikacji NoMachine użyć komendy:
> vmd
- Z programu VMD można także korzystać po uruchomieniu zadania interaktywnego i załadowaniu odpowiedniego modułu:
> qsub -X -I -l walltime=6:00:00 > module load vmd/1.9.3-gcc6.2.0 > vmd
VMD w sieci
Zobacz też: Oprogramowanie KDM
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|