-----------------------------------------------
⚠️ This wiki is obsolete. Visit the new one at https://man.e-science.pl/en/kdm
⚠️ Ta wiki jest nieaktualna. Odwiedź nową pod adresem https://man.e-science.pl/kdm
-----------------------------------------------
Beast
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Beast
| Beast | |
|---|---|
| |
| Serwer | Wersja |
| Bem | 2.5.1 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Beast - program do Bayesowskiej analizy filogenetycznej sekwencji molekularnych, jest opracowywany przez zespół naukowców z całego świata.
Licencja
Program jest udostępniany na licencji GNU Lesser General Public License.
Korzystanie w WCSS
Beast dostępny jest na klastrze Bem w katalogu /usr/local/beast/ w wersji 2.5.1.
/usr/local/beast/
`-- 2.5.1/
`-- with_jre1.8.0_161/
|-- LICENSE.txt
|-- README.txt
|-- VERSION\ HISTORY.txt
|-- bin/
|-- examples/
|-- images/
|-- jre1.8.0_161/
|-- lib/
`-- templates/
Środowisko
Środowisko programu należy uruchomić wykonując polecenie:
> module load beast/2.5.1-with_JRE
lub w skrócie:
> module load beast
Jak korzystać
Lista dostępnych opcji:
> beast -help
Beast2 używa formatu wejściowego XML.
Beast2 jest kompatybilny z bibliotekami beagle-lib, które również są dostępne na klastrze Bem.
Biblioteka beagle/3.0.2-gcc6.2.0 jest dostępna wraz z uruchomieniem środowiska Beast 2.5.1.
Program posiada również graficzny interfejs użytkownika.
Zobacz: jak korzystać z NoMachine.
Tutorial
Dokumentacja
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|