NBO

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < NBO

NBO
Serwer	Wersja
Bem	6.0
Kontakt
kdm@wcss.pl

NBO

Program NBO analizuje wieloelektronową funkcję falową pod względem lokalizacji par elektronowych cząsteczki. Wykorzystuje rozkład gęstości elektronowej, w celu określenia najbardziej trafnej struktury Lewisa.

Program determinuje:

• Naturalny orbital atomowy (NAOs)
• Naturalny orbital hybrydowy (NHOs)
• Naturalny orbital wiążący (NBOs)
• Naturalnie zlokalizowany orbital molekularny (NLMOs)

Wstawianie zadań

• użycie NBO wymaga załadowania modułu w skrypcie zadania lub z linii poleceń w trakcie zadania interaktywnego:

module load nbo/6.0

• użycie NBO wraz z Gaussianem 2009 D.01 wymaga załadowania innego modułu i następnie uruchomienie g09. Zalecane jest użycie zadania interaktywnego. Jeśli zadanie g09 wymaga podania liczby procesorów lub wielkości pamięci innych niż domyślne, to należy dodać odpowiednie karty %nproc i %mem do pliku danych g09.

module load nbo/6.0-g09d01
g09 plik_danych.inp plik_wynikow.log

• Aktualnie NBO nie posiada wsparcia dla najnowszego Gaussiana 2009 E01. Mimo to, WCSS udostępnia moduł do użycia na własną odpowiedzialność użytkowników:

module load nbo/6.0-g09e01

• użycie NBO wraz z GAMESS-em mozliwe jest poprzez zlecenie zadania przy użyciu skryptu:

sub-gamess

• użycia NBO wraz z Orca poprzez załadowanie modułów:

module load nbo/6.0-orca4
module load orca/4.0.0-intel16.0

Informacje o wykorzystaniu

Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):

"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "

"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."

NBO w sieci

• Strona domowa NBO