MOPAC: Różnice pomiędzy wersjami
| (Nie pokazano 1 wersji utworzonej przez jednego użytkownika) | |||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < MOPAC</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < MOPAC</small> | ||
| − | {{aplikacja|nazwa=MOPAC|logo=|serwer=[[ | + | {{aplikacja|nazwa=MOPAC|logo=|serwer=[[Bem]]|wersja=2012}} |
| − | ''' | + | '''MOPAC''' - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ''ab initio'' (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo. |
=== MOPAC w WCSS === | === MOPAC w WCSS === | ||
| − | Pakiet zainstalowany jest na klastrze [[ | + | Pakiet zainstalowany jest na klastrze [[Bem]]. |
Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako [[PBS#Zadania_interaktywne|zadanie interaktywne]]: | Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako [[PBS#Zadania_interaktywne|zadanie interaktywne]]: | ||
| − | qsub -I -l software=Mopac | + | qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=Mopac |
Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego [[modules|modułu]]: | Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego [[modules|modułu]]: | ||
| Linia 15: | Linia 15: | ||
mopac plik.mop | mopac plik.mop | ||
| + | <!-- | ||
Zadania obliczeniowe wstawia się do kolejki wywołując: | Zadania obliczeniowe wstawia się do kolejki wywołując: | ||
sub-mopac plik.mop [ pamiec ] [ kolejka ] | sub-mopac plik.mop [ pamiec ] [ kolejka ] | ||
Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki <code>normal</code> z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci. | Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki <code>normal</code> z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci. | ||
| − | + | --> | |
| + | === Informacje o wykorzystaniu === | ||
| + | {{Podziękowanie_WCSS}} | ||
=== MOPAC w sieci === | === MOPAC w sieci === | ||
* [http://openmopac.net/ Strona domowa pakietu] | * [http://openmopac.net/ Strona domowa pakietu] | ||
Aktualna wersja na dzień 15:22, 23 lut 2016
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < MOPAC
| MOPAC | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Bem | 2012 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
MOPAC - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ab initio (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo.
MOPAC w WCSS
Pakiet zainstalowany jest na klastrze Bem.
Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako zadanie interaktywne:
qsub -I -l walltime=06:00:00 -l software=Mopac
Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego modułu:
module load mopac
Program można wywoływać poleceniem:
mopac plik.mop
Informacje o wykorzystaniu
Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):
"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "
"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."
MOPAC w sieci
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|