Rosetta: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| (Nie pokazano 2 wersji utworzonych przez 2 użytkowników) | |||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Rosetta</small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < Rosetta</small> | ||
| − | {{aplikacja|nazwa=Rosetta|logo=[[Plik:rosetta.png|noframe|center]]|serwer=[[ | + | {{aplikacja|nazwa=Rosetta|logo=[[Plik:rosetta.png|noframe|center]]|serwer=[[Bem]]|wersja=3.10}} |
=== Rosetta === | === Rosetta === | ||
| − | Program Rosetta służy do modelowania | + | Program Rosetta służy do modelowania struktury białek. |
Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek, enzymów de novo, łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów. | Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek, enzymów de novo, łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów. | ||
=== Licencja === | === Licencja === | ||
| − | Program Rosetta jest | + | Program Rosetta jest dostępny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkowników za darmo. Licencje można uzyskać na stronie [https://www.rosettacommons.org/software/license-and-download Licencja ] |
=== Środowisko i praca interaktywna === | === Środowisko i praca interaktywna === | ||
| Linia 15: | Linia 15: | ||
Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie: | Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie: | ||
| − | > module load | + | > module load Rosetta/3.10-foss-2016b (dla wersji domyślnej - najnowszej) |
=== Rosetta w sieci === | === Rosetta w sieci === | ||
*[https://www.rosettacommons.org/software Strona domowa] | *[https://www.rosettacommons.org/software Strona domowa] | ||
| + | |||
| + | |||
| + | {{oprogramowanie}} | ||
| + | [[Kategoria:Oprogramowanie]] | ||
Aktualna wersja na dzień 10:50, 31 sty 2020
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Rosetta
| Rosetta | |
|---|---|
 | |
| Serwer | Wersja |
| Bem | 3.10 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Rosetta
Program Rosetta służy do modelowania struktury białek. Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek, enzymów de novo, łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów.
Licencja
Program Rosetta jest dostępny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkowników za darmo. Licencje można uzyskać na stronie Licencja
Środowisko i praca interaktywna
Praca z pakietem w trybie interaktywnym jest możliwa po uruchomieniu zadania interaktywnego w jednej z kolejek PBS, np:
> qsub -I -q short6h
Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie:
> module load Rosetta/3.10-foss-2016b (dla wersji domyślnej - najnowszej)
Rosetta w sieci
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|