MOPAC: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 1: | Linia 1: | ||
| − | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]]</small> | + | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < MOPAC</small> |
{{aplikacja|nazwa=MOPAC|logo=|serwer=[[Supernova]]|wersja=2009}} | {{aplikacja|nazwa=MOPAC|logo=|serwer=[[Supernova]]|wersja=2009}} | ||
| − | '''MOPAC2009''' - | + | '''MOPAC2009''' - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ''ab initio'' (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo. |
Metody w MOPAC2009: | Metody w MOPAC2009: | ||
| Linia 9: | Linia 9: | ||
*[[PM6]] | *[[PM6]] | ||
*[[MOZYME]] | *[[MOZYME]] | ||
| + | |||
| + | === MOPAC w WCSS === | ||
| + | Pakiet zainstalowany jest na klastrze [[Supernova]]. | ||
| + | |||
| + | Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako [[PBS#Zadania_interaktywne|zadanie interaktywne]]: | ||
| + | qsub -I -l software=Mopac | ||
| + | |||
| + | Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego [[modules|modułu]]: | ||
| + | module load mopac | ||
| + | |||
| + | Program można wywoływać poleceniem: | ||
| + | mopac plik.mop | ||
| + | |||
| + | Zadania obliczeniowe wstawia się do kolejki wywołując: | ||
| + | sub-mopac plik.mop [ pamiec ] [ kolejka ] | ||
| + | |||
| + | Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki <code>normal</code> z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci. | ||
=== MOPAC w sieci === | === MOPAC w sieci === | ||
Wersja z 10:59, 27 lis 2012
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < MOPAC
| MOPAC | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 2009 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
MOPAC2009 - aplikacja, w której zaimplementowano półempiryczne metody chemii obliczeniowej, stosowane w przypadku układów, których liczenie tradycyjnymi metodami ab initio (HF, CCSD, CI itd.) byłoby zbyt kosztowne obliczeniowo.
Metody w MOPAC2009:
MOPAC w WCSS
Pakiet zainstalowany jest na klastrze Supernova.
Testowe uruchomienia programu powinny być wykonywane jako zadanie interaktywne:
qsub -I -l software=Mopac
Następnie program można uruchomić po wgraniu odpowiedniego modułu:
module load mopac
Program można wywoływać poleceniem:
mopac plik.mop
Zadania obliczeniowe wstawia się do kolejki wywołując:
sub-mopac plik.mop [ pamiec ] [ kolejka ]
Domyślnie zadanie zostanie wstawione do kolejki normal z przydziałem 1 rdzenia i 1800MB pamięci.
MOPAC w sieci
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|