Tripos Sybyl: Różnice pomiędzy wersjami

Z KdmWiki
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Linia 83: Linia 83:
  
 
== Dokumentacja ==
 
== Dokumentacja ==
Dokumentacja on-line dostępna na serwerze usługowym KDM:
 
* [http://sol.wcss.wroc.pl:5080/TriposBookshelf/ Tripos Bookshelf] (dostępna wyłącznie z komputerów sieci [[WASK]])
 
;Linki zewnętrzne
 
 
* [http://www.tripos.com/index.php?family=modules,SimplePage,,,&page=comp_informatics Opis produktu]
 
* [http://www.tripos.com/index.php?family=modules,SimplePage,,,&page=comp_informatics Opis produktu]
  

Wersja z 08:14, 15 paź 2012

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Tripos Sybyl

SYBYL
Serwer Wersja
Klaster kampusowy Sybyl-X 1.3
Sybyl-X 2.0
Do pobrania Sybyl-X 1.3
Sybyl-X 2.0
Kontakt
kdm@wcss.pl

SYBYL - pakiet chemiczny firmy Tripos. SYBYL jest oprogramowaniem do modelowania molekularnego, umożliwiającym projektowanie, analizę i wizualizację struktur molekularnych.

Licencja

WCSS udostępnia pakiet SYBYL w ramach krajowej licencji na oprogramowanie firmy Tripos, koordynowanej przez ICM (strona licencji krajowej: http://www.icm.edu.pl/kdm/Tripos).

Licencja jest ważna do 30 września 2012. Użytkownicy planujący wykorzystanie Sybyla po tej dacie proszeni są o zgłaszanie swoich planów administratorom.

Sybyl w WCSS

Oprogramowanie Sybyl-X udostępniane jest na klastrze kampusowym oraz do zainstalowania na swoim komputerze (Windows, Mac OS, Linux). W celu ustalenia możliwości udostępnienia prosimy kontaktować się z administratorami.

Sprawdzanie dostępności modułów

Ponieważ Tripos Sybyl jest udostępniany w ramach licencji krajowej może się zdarzyć, że poszczególne moduły będą w danej chwili w użyciu i trzeba poczekać na zwolnienie się odpowiedniej liczby tokenów. Każdy użytkownik może sprawdzić aktualny stan wykorzystania modułów odpytując serwer licencji:

  • na serwerze wykonać polecenie, np. dla tcsh:
> setenv LM_LICENSE_FILE 1705@krankenschwester.icm.edu.pl
> lmstat -a 
  • dla wygody można wynik polecenia przekierować do pliku
> lmstat -a > sybyl.status.txt
> less sybyl.status.txt

Lista modułów

  • SYBYL BASE
  • CONCORD-SKETCH
  • MOLCAD
  • ADVANCED COMPUTATION
  • RECEPTOR
  • GASP
  • DISCOtech
  • HQSAR
  • QSAR
  • ADVANCED CoMFA
  • BIOPOLYMER
  • COMPOSER
  • GeneFold
  • ProTable
  • MatchMaker
  • LeapFrog
  • Legion
  • Selector
  • DYNAMICS
  • TRIAD
  • MARDIGRAS+
  • Almond
  • Tuplets
  • Fugue
  • Rachel
  • Hint!
  • ZAP
  • OptDesign
  • Molconn-Z
  • UNITY Base
  • UNITY 3D
  • UNITY Extra Search Engine
  • CONCORD-STAND ALONE
  • Power CONCORD
  • StereoPlex
  • Distill
  • SiteID
  • Confort
  • Confort 3D
  • ClogP
  • Diverse Solutions
  • VolSurf
  • Cscore

Nowe moduły

Uwaga - wycofano oprogramowanie FlexX.

Dokumentacja


Zobacz też: Oprogramowanie KDM