VMD: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 1: | Linia 1: | ||
<small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < VMD </small> | <small>< [[Podręcznik użytkownika KDM]] < [[Oprogramowanie KDM]] < [[Oprogramowanie naukowe]] < VMD </small> | ||
{{aplikacja|nazwa=VMD|serwer=[[Supernova]]|wersja=1.9.1|}} | {{aplikacja|nazwa=VMD|serwer=[[Supernova]]|wersja=1.9.1|}} | ||
| + | == VMD == | ||
| − | + | ''VMD'' (Visual Molecular Dynamics) – oprogramowanie do modelowania, wizualizacji i analizy systemów biologicznych (m.in. białek, kwasów nukleinowych, lipidów). | |
| − | + | == Licencja == | |
| + | |||
| + | Aby uzyskać dostęp do modułu VMD należy dokonać rejestracji na [http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/ stronie domowej produktu], zrobić zrzut ekranu potwierdzający proces rejestracji ([http://kdm.wcss.wroc.pl/wiki/Plik:Screenvmd.png Przykładowy zrzut]), a następnie wysłać na adres kdm@wcss.pl. | ||
| + | |||
| + | == Uruchamianie na klastrze == | ||
| + | |||
| + | * Należy przekierować wyświetlanie wg. [[Przekierowanie wyświetlania | instrukcji ]] | ||
| + | * Załadować moduł poleceniem : | ||
| + | module load vmd | ||
| + | * Uruchomić program poleceniem : | ||
| + | vmd | ||
| + | |||
| + | |||
| + | == VMD w sieci == | ||
* [http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/allversions/what_is_vmd.html Strona domowa VMD] | * [http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/allversions/what_is_vmd.html Strona domowa VMD] | ||
* [http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/vmd-index.html Tutoriale] | * [http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/vmd-index.html Tutoriale] | ||
Wersja z 12:37, 15 lip 2014
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < VMD
| VMD | |
|---|---|
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 1.9.1 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
VMD
VMD (Visual Molecular Dynamics) – oprogramowanie do modelowania, wizualizacji i analizy systemów biologicznych (m.in. białek, kwasów nukleinowych, lipidów).
Licencja
Aby uzyskać dostęp do modułu VMD należy dokonać rejestracji na stronie domowej produktu, zrobić zrzut ekranu potwierdzający proces rejestracji (Przykładowy zrzut), a następnie wysłać na adres kdm@wcss.pl.
Uruchamianie na klastrze
- Należy przekierować wyświetlanie wg. instrukcji
- Załadować moduł poleceniem :
module load vmd
- Uruchomić program poleceniem :
vmd
VMD w sieci
Zobacz też: Oprogramowanie KDM
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|