Molden: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
| Linia 17: | Linia 17: | ||
# uruchomić program poleceniem molden | # uruchomić program poleceniem molden | ||
#:<pre>$ molden</pre> | #:<pre>$ molden</pre> | ||
| + | |||
| + | ;Informacje o wykorzystaniu | ||
| + | {{Podziękowanie_WCSS}} | ||
;Molden w sieci | ;Molden w sieci | ||
Wersja z 11:58, 21 lip 2014
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Molden
| Molden | |
|---|---|
| |
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 5.0 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Molden - program do pre- i postprocessingu struktur molekularnych.
- Główne zastosowania
- Czytanie outputu z programów chemicznych takich jak Gaussian, Gamess i Molpro.
- Tworzenie graficznego formatu orbitali molekularnych i gęstości molekularnej.
- Animacja ścieżki reakcji.
- Zaawansowany edytor Z-Matrix.
- Aby uruchomić Moldena na Supernovej należy
- zalogować się z przekierowaniem wyświetlania
- wstawić graficzne zadanie interaktywne
$ qsub -I -X -l software=Molden
- załadować moduł molden
$ module load molden
- uruchomić program poleceniem molden
$ molden
- Informacje o wykorzystaniu
Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):
"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "
"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."
- Molden w sieci
Zobacz też : oprogramowanie KDM
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|