Rosetta: Różnice pomiędzy wersjami
Przejdź do nawigacji
Przejdź do wyszukiwania
m |
|||
| Linia 3: | Linia 3: | ||
=== Rosetta === | === Rosetta === | ||
| − | Program Rosetta służy do modelowania | + | Program Rosetta służy do modelowania struktury białek. |
Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek, enzymów de novo, łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów. | Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek, enzymów de novo, łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów. | ||
=== Licencja === | === Licencja === | ||
| − | Program Rosetta jest | + | Program Rosetta jest dostępny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkowników za darmo. Licencje można uzyskać na stronie [https://www.rosettacommons.org/software/license-and-download Licencja ] |
=== Środowisko i praca interaktywna === | === Środowisko i praca interaktywna === | ||
Wersja z 07:41, 3 gru 2014
< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < Rosetta
| Rosetta | |
|---|---|
 | |
| Serwer | Wersja |
| Supernova | 3.2.1 |
| Kontakt | |
| kdm@wcss.pl | |
Rosetta
Program Rosetta służy do modelowania struktury białek. Zaawansowany algorytm umożliwia tworzenie białek, enzymów de novo, łączenie ligandów oraz przewidywanie struktury złożonych kompleksów.
Licencja
Program Rosetta jest dostępny dla komercyjnych i niekomercyjnych użytkowników za darmo. Licencje można uzyskać na stronie Licencja
Środowisko i praca interaktywna
Praca z pakietem w trybie interaktywnym jest możliwa po uruchomieniu zadania interaktywnego w jednej z kolejek PBS, np:
> qsub -I -q short6h
Środowisko programu inicjalizowane jest w powłoce przez polecenie:
> module load rosetta/3.2.1 (dla wersji domyślnej - najnowszej)
Rosetta w sieci
| Oprogramowanie naukowe |
Abaqus ⋅ ABINIT ⋅ ADF ⋅ Amber ⋅ ANSYS [ ANSYS CFD: Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] ⋅ AutoDock ⋅ BAGEL ⋅ Beast ⋅ Biovia [ Materials Studio, Discovery Studio ] ⋅ Cfour ⋅ Comsol ⋅ CP2K ⋅ CPMD ⋅ CRYSTAL ⋅ Dalton ⋅ Dask ⋅ DIRAC ⋅ FDS-SMV ⋅ GAMESS ⋅ Gaussian ⋅ Gromacs ⋅ IDL ⋅ Lumerical [ FDTD, MODE ] ⋅ Mathcad ⋅ Mathematica⋅ Matlab ⋅ Molcas ⋅ Molden ⋅ Molpro ⋅ MOPAC ⋅ NAMD ⋅ NBO ⋅ NWChem ⋅ OpenFOAM ⋅ OpenMolcas ⋅ Orca ⋅ Quantum ESPRESSO ⋅ R ⋅ Rosetta ⋅ SIESTA ⋅ Tinker ⋅ TURBOMOLE ⋅ VASP ⋅ VMD ⋅ WIEN2k |
|---|