NBO

Z KdmWiki
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM < Oprogramowanie naukowe < NBO

NBO
Serwer Wersja
Bem 6.0
Kontakt
kdm@wcss.pl

NBO

Program NBO analizuje wieloelektronową funkcję falową pod względem lokalizacji par elektronowych cząsteczki. Wykorzystuje rozkład gęstości elektronowej, w celu określenia najbardziej trafnej struktury Lewisa.

Program determinuje:

  • Naturalny orbital atomowy (NAOs)
  • Naturalny orbital hybrydowy (NHOs)
  • Naturalny orbital wiążący (NBOs)
  • Naturalnie zlokalizowany orbital molekularny (NLMOs)

Wstawianie zadań

  • użycie NBO wymaga załadowania modułu w skrypcie zadania lub z linii poleceń w trakcie zadania interaktywnego:
module load nbo/6.0
  • użycie NBO wraz z Gaussianem 2009 D.01 wymaga załadowania innego modułu i następnie uruchomienie g09. Zalecane jest użycie zadania interaktywnego. Jeśli zadanie g09 wymaga podania liczby procesorów lub wielkości pamięci innych niż domyślne, to należy dodać odpowiednie karty %nproc i %mem do pliku danych g09.
module load nbo/6.0-g09d01
g09 plik_danych.inp plik_wynikow.log
  • Aktualnie NBO nie posiada wsparcia dla najnowszego Gaussiana 2009 E01. Mimo to, WCSS udostępnia moduł do użycia na własną odpowiedzialność użytkowników:
module load nbo/6.0-g09e01
  • użycie NBO wraz z GAMESS-em mozliwe jest poprzez zlecenie zadania przy użyciu skryptu:
sub-gamess

Informacje o wykorzystaniu

Wszelkie publikacje, (w tym prace doktorskie i dyplomowe) wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):

"Obliczenia wykonano na komputerach Wrocławskiego Centrum Sieciowo-Superkomputerowego (http://www.wcss.pl), grant obliczeniowy Nr ... "

"Calculations have been carried out in Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://www.wcss.pl), grant No. ..."

NBO w sieci