Oprogramowanie KDM

Z KdmWiki
(Przekierowano z Oprogramowanie)
Skocz do: nawigacji, wyszukiwania

< Podręcznik użytkownika KDM < Oprogramowanie KDM

Na Komputerach Dużej Mocy WCSS udostępniany jest szereg programów wspomagających kadrę naukową uczelni wrocławskich w prowadzeniu pracy naukowej w efektywny i nowoczesny sposób. W przypadku dużego zapotrzebowania użytkowników na specjalistyczne oprogramowanie o przeznaczeniu naukowym, WCSS może podjąć się jego zakupu. Poza gotowymi produktami, serwery wyposażone są także w środowiska programistyczne umożliwiające użytkownikom pisanie i kompilowanie własnych programów.

Abaqus ABINIT AutoDock BioviaMaterials Studio, Discovery Studio ] ADF Amber ANSYSANSYS CFD:  Fluent, CFX, ICEM; Mechanical ] Cfour Comsol CP2K CPMD CRYSTAL09 Dalton FDS-SMV GAMESS Gaussian Gromacs IDL LumericalFDTD, MODE ] Maple Mathcad Mathematica Matlab Molcas Molden Molpro MOPAC NAMD NBO NWChem OpenFOAM Orca R Rosetta SIESTA Tinker TURBOMOLE VMD WIEN2k

Zalecania ogólne

Najwięcej problemów sprawiają zadania wymagające dużo dysku. Jeśli zadanie generuje kilkadziesiąt (lub więcej) GB danych, to wyszukanie np. wartości całki w takim pliku może zająć więcej czasu niż jej doliczenie na szybkiej maszynie. Wtedy, w programach kwantowo-chemicznych należy używać trybu direct. Dodatkowo, silne obciążenie podsystemu dyskowego komputera spowalnia całą maszynę i opóźnia realizację zadań innych użytkowników. Oczywiście zadania, których nie można uruchomić w trybie bezpośrednim (direct), ciągle można liczyć w WCSS. Należy jednak pamiętać, że jeśli zagrozi to przepełnieniem przestrzeni /scratch i przerwaniem działania innych zadań, to zadanie takie zostanie zabite bez ostrzeżenia.